Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mid1ip1Q9CQ20 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mid1ip1Q9CQ20 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms