Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe41Q99PV5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe41Q99PV5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhe41Q99PV5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe41Q99PV5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe41Q99PV5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe41Q99PV5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe41Q99PV5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe41Q99PV5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe41Q99PV5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe41Q99PV5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe41Q99PV5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe41Q99PV5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms