Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prpf8Q99PV0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf8Q99PV0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms