Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim12aQ99PQ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim12aQ99PQ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim12aQ99PQ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim12aQ99PQ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim12aQ99PQ1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim12aQ99PQ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim12aQ99PQ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim12aQ99PQ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim12aQ99PQ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim12aQ99PQ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim12aQ99PQ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim12aQ99PQ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim12aQ99PQ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim12aQ99PQ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim12aQ99PQ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim12aQ99PQ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim12aQ99PQ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim12aQ99PQ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim12aQ99PQ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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