Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2a1Q99PM3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf2a1Q99PM3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2a1Q99PM3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2a1Q99PM3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2a1Q99PM3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2a1Q99PM3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2a1Q99PM3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2a1Q99PM3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2a1Q99PM3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2a1Q99PM3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2a1Q99PM3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2a1Q99PM3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2a1Q99PM3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2a1Q99PM3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2a1Q99PM3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2a1Q99PM3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2a1Q99PM3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms