Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcam1Q99NB3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcam1Q99NB3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcam1Q99NB3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms