Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q99M08 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q99M08 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q99M08 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q99M08 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99M08 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99M08 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99M08 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99M08 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99M08 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q99M08 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99M08 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99M08 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99M08 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q99M08 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q99M08 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99M08 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99M08 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99M08 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99M08 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99M08 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q99M08 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99M08 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99M08 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99M08 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99M08 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99M08 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99M08 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99M08 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99M08 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99M08 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99M08 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q99M08 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99M08 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99M08 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99M08 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99M08 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99M08 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99M08 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99M08 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99M08 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99M08 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99M08 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99M08 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99M08 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99M08 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99M08 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99M08 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99M08 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99M08 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99M08 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99M08 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99M08 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99M08 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99M08 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99M08 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99M08 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99M08 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99M08 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99M08 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99M08 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99M08 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99M08 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99M08 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99M08 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99M08 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99M08 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99M08 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99M08 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q99M08 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q99M08 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q99M08 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q99M08 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99M08 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99M08 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99M08 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99M08 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99M08 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99M08 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99M08 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99M08 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99M08 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99M08 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99M08 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q99M08 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q99M08 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99M08 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q99M08 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99M08 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99M08 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q99M08 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99M08 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99M08 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99M08 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99M08 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99M08 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99M08 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99M08 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99M08 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99M08 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms