Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gins4Q99LZ3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gins4Q99LZ3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gins4Q99LZ3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gins4Q99LZ3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms