Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smtnl1Q99LM3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smtnl1Q99LM3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smtnl1Q99LM3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms