Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnpo2Q99LG2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnpo2Q99LG2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnpo2Q99LG2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnpo2Q99LG2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms