Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gps1Q99LD4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gps1Q99LD4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gps1Q99LD4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms