Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Reep3Q99KK1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Reep3Q99KK1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Reep3Q99KK1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Reep3Q99KK1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Reep3Q99KK1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Reep3Q99KK1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Reep3Q99KK1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Reep3Q99KK1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Reep3Q99KK1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Reep3Q99KK1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Reep3Q99KK1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Reep3Q99KK1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Reep3Q99KK1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms