Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hps4Q99KG7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hps4Q99KG7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms