Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdxdc1Q99K01 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdxdc1Q99K01 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdxdc1Q99K01 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms