Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krcc1Q99JT5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krcc1Q99JT5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krcc1Q99JT5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krcc1Q99JT5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms