Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf144aQ925F3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf144aQ925F3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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