Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Spdl1Q923A2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Spdl1Q923A2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spdl1Q923A2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spdl1Q923A2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms