Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ3

Thyn1, Thymocyte nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thyn1Q91YJ3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Thyn1Q91YJ3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thyn1Q91YJ3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Thyn1Q91YJ3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms