Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y14

Pcdha6, Pcdha6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha6Q91Y14 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Pcdha6Q91Y14 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha6Q91Y14 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha6Q91Y14 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms