Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lims2Q91XD2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lims2Q91XD2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lims2Q91XD2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lims2Q91XD2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lims2Q91XD2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms