Protein–RNA interactions for Protein: Q91V17

Znrf1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf1Q91V17 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znrf1Q91V17 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znrf1Q91V17 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znrf1Q91V17 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znrf1Q91V17 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znrf1Q91V17 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms