Protein–RNA interactions for Protein: Q8VF39

Olfr1278, Olfactory receptor, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Olfr1278Q8VF39 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Olfr1278Q8VF39 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Olfr1278Q8VF39 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Olfr1278Q8VF39 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Olfr1278Q8VF39 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Olfr1278Q8VF39 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Olfr1278Q8VF39 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Olfr1278Q8VF39 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Olfr1278Q8VF39 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Olfr1278Q8VF39 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Olfr1278Q8VF39 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Olfr1278Q8VF39 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Olfr1278Q8VF39 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Olfr1278Q8VF39 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Olfr1278Q8VF39 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Olfr1278Q8VF39 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Olfr1278Q8VF39 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Olfr1278Q8VF39 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Olfr1278Q8VF39 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Olfr1278Q8VF39 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Olfr1278Q8VF39 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Olfr1278Q8VF39 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Olfr1278Q8VF39 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Olfr1278Q8VF39 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Olfr1278Q8VF39 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Olfr1278Q8VF39 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Olfr1278Q8VF39 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Olfr1278Q8VF39 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Olfr1278Q8VF39 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Olfr1278Q8VF39 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Olfr1278Q8VF39 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Olfr1278Q8VF39 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Olfr1278Q8VF39 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Olfr1278Q8VF39 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Olfr1278Q8VF39 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Olfr1278Q8VF39 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Olfr1278Q8VF39 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Olfr1278Q8VF39 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Olfr1278Q8VF39 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Olfr1278Q8VF39 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Olfr1278Q8VF39 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Olfr1278Q8VF39 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Olfr1278Q8VF39 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Olfr1278Q8VF39 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Olfr1278Q8VF39 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Olfr1278Q8VF39 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Olfr1278Q8VF39 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms