Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt79Q8VED5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt79Q8VED5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt79Q8VED5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt79Q8VED5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt79Q8VED5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt79Q8VED5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt79Q8VED5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt79Q8VED5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt79Q8VED5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt79Q8VED5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt79Q8VED5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt79Q8VED5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt79Q8VED5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt79Q8VED5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt79Q8VED5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms