Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q8VDP2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8VDP2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8VDP2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8VDP2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8VDP2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8VDP2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8VDP2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8VDP2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8VDP2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8VDP2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8VDP2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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