Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Ubxn4Q8VCH8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ubxn4Q8VCH8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubxn4Q8VCH8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn4Q8VCH8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn4Q8VCH8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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