Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpap2Q8VC34 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpap2Q8VC34 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpap2Q8VC34 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpap2Q8VC34 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpap2Q8VC34 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpap2Q8VC34 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpap2Q8VC34 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rpap2Q8VC34 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rpap2Q8VC34 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpap2Q8VC34 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms