Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BbxQ8VBW5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BbxQ8VBW5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BbxQ8VBW5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms