Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C0

Mcmbp, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
McmbpQ8R3C0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
McmbpQ8R3C0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
McmbpQ8R3C0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
McmbpQ8R3C0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
McmbpQ8R3C0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
McmbpQ8R3C0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
McmbpQ8R3C0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
McmbpQ8R3C0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
McmbpQ8R3C0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
McmbpQ8R3C0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
McmbpQ8R3C0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
McmbpQ8R3C0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
McmbpQ8R3C0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
McmbpQ8R3C0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
McmbpQ8R3C0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
McmbpQ8R3C0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
McmbpQ8R3C0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
McmbpQ8R3C0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms