Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Hecw1Q8K4P8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Hecw1Q8K4P8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Hecw1Q8K4P8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Hecw1Q8K4P8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Hecw1Q8K4P8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Hecw1Q8K4P8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Hecw1Q8K4P8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Hecw1Q8K4P8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Hecw1Q8K4P8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Hecw1Q8K4P8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Hecw1Q8K4P8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Hecw1Q8K4P8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Hecw1Q8K4P8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Hecw1Q8K4P8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Hecw1Q8K4P8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Hecw1Q8K4P8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Hecw1Q8K4P8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Hecw1Q8K4P8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Hecw1Q8K4P8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Hecw1Q8K4P8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Hecw1Q8K4P8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Hecw1Q8K4P8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Hecw1Q8K4P8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Hecw1Q8K4P8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Hecw1Q8K4P8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Hecw1Q8K4P8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Hecw1Q8K4P8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Hecw1Q8K4P8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Hecw1Q8K4P8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Hecw1Q8K4P8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Hecw1Q8K4P8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Hecw1Q8K4P8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Hecw1Q8K4P8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Hecw1Q8K4P8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Hecw1Q8K4P8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms