Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssh3Q8K330 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssh3Q8K330 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssh3Q8K330 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms