Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brd3Q8K2F0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brd3Q8K2F0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brd3Q8K2F0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd3Q8K2F0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms