Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIV2

Tmem259, Membralin, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem259Q8CIV2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem259Q8CIV2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem259Q8CIV2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem259Q8CIV2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem259Q8CIV2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem259Q8CIV2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem259Q8CIV2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem259Q8CIV2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem259Q8CIV2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem259Q8CIV2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem259Q8CIV2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem259Q8CIV2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem259Q8CIV2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem259Q8CIV2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem259Q8CIV2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms