Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
9030612E09RikQ8CE20 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
9030612E09RikQ8CE20 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms