Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam228aQ8CDW1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam228aQ8CDW1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam228aQ8CDW1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam228aQ8CDW1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms