Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc87Q8CDL9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc87Q8CDL9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc87Q8CDL9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc87Q8CDL9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms