Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrif1Q8CDD9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrif1Q8CDD9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrif1Q8CDD9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrif1Q8CDD9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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