Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
E4f1Q8CCE9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E4f1Q8CCE9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
E4f1Q8CCE9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E4f1Q8CCE9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms