Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacnb2Q8CC27 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacnb2Q8CC27 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacnb2Q8CC27 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacnb2Q8CC27 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms