Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB59

Fam161b, Protein FAM161B, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam161bQ8CB59 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam161bQ8CB59 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam161bQ8CB59 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam161bQ8CB59 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam161bQ8CB59 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam161bQ8CB59 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam161bQ8CB59 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms