Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Spef2Q8C9J3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Spef2Q8C9J3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Spef2Q8C9J3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Spef2Q8C9J3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Spef2Q8C9J3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms