Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfibp1Q8C8U0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppfibp1Q8C8U0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppfibp1Q8C8U0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms