Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1Y8

Ccz1, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccz1Q8C1Y8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccz1Q8C1Y8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccz1Q8C1Y8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccz1Q8C1Y8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms