Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Y1

Tgif2, Homeobox protein TGIF2, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif2Q8C0Y1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgif2Q8C0Y1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tgif2Q8C0Y1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgif2Q8C0Y1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgif2Q8C0Y1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms