Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgef5Q8C0Q9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rapgef5Q8C0Q9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef5Q8C0Q9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rapgef5Q8C0Q9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef5Q8C0Q9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef5Q8C0Q9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef5Q8C0Q9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rapgef5Q8C0Q9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rapgef5Q8C0Q9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rapgef5Q8C0Q9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgef5Q8C0Q9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgef5Q8C0Q9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgef5Q8C0Q9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rapgef5Q8C0Q9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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