Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nek11Q8C0Q4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nek11Q8C0Q4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nek11Q8C0Q4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Nek11Q8C0Q4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nek11Q8C0Q4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
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