Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXZ0

Ctxn3, Cortexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn3Q8BXZ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctxn3Q8BXZ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctxn3Q8BXZ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctxn3Q8BXZ0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctxn3Q8BXZ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctxn3Q8BXZ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctxn3Q8BXZ0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctxn3Q8BXZ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctxn3Q8BXZ0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctxn3Q8BXZ0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctxn3Q8BXZ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctxn3Q8BXZ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctxn3Q8BXZ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms