Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc169Q8BXX9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc169Q8BXX9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc169Q8BXX9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms