Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp398Q8BV16 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp398Q8BV16 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms