Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E330017A01RikQ8BU47 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
E330017A01RikQ8BU47 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E330017A01RikQ8BU47 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms