Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup54Q8BTS4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup54Q8BTS4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup54Q8BTS4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms